Український центр профілактики і боротьби зі СНІДом Міністерства охорони здоров'я України розпочав свою діяльність з січня 2001 року на підставі спільного наказу Академії медичних наук та МОЗ України від 13.12.2000 року № 63/333 "Про створення Українського Центру профілактики і боротьби зі СНІДом МОЗ України".  

В структурі Центру:

• відділ організації лікування хворих на СНІД;
• відділення епідеміологічного моніторингу;
• організаційно-методичний відділ;
• лабораторія імунології ВІЛ-інфекції;
• лабораторія вірусологічних досліджень.

Основними завданнями Центру є:

• організаційно-методична діяльність;
• аналітично-інформаційна діяльність;
• санітарно-просвітницька діяльність;
• здійснення епідеміологічного моніторингу за ВІЛ-інфекцією і СНІДом;
• організація надання спеціалізованої лікувально-профілактичної допомоги ВІЛ-інфікованим і хворим на СНІД;
• проведення експертної оцінки діагностичних досліджень, адекватності лікування ВІЛ-інфікованим та хворим на СНІД;
• підготовка пропозицій щодо запобігання розповсюдженню на території України епідемії ВІЛ-інфекції/СНІДу;
• участь у розробці нормативно-правових актів.

Центр відповідно до покладених на нього завдань:

• здійснює методичне керівництво діяльністю обласних (міських) центрів профілактики СНІДу;
• здійснює загальний контроль за діяльністю обласних (міських) центрів профілактики СНІДу;
• бере участь у розробці, реалізації та координації державної політики у сфері організації надання спеціалізованої лікувально-профілактичної, діагностичної, консультативної допомоги ВІЛ-інфікованим і хворим на СНІД;
• надає організаційно-методичну допомогу лікувально-профілактичним закладам та центрам профілактики СНІДу незалежно від їх підпорядкування;
• готує пропозиції з питань організаційно-методичного керівництва діяльності закладів охорони здоров'я щодо надання спеціалізованої лікувально-профілактичної допомоги ВІЛ-інфікованим і хворим на СНІД;
• забезпечує проведення основних організаційних заходів з профілактики та боротьби з ВІЛ-інфекцією/СНІДом закладами, що працюють в галузі боротьби з ВІЛ-інфекцією/СНІДом, які є обов'язковими для виконання незалежно від їх підпорядкування, контролює їх виконання;
• готує пропозиції з питань, пов'язаних з профілактикою ВІЛ-інфекції/СНІДу, для прийняття відповідних рішень Міністерством охорони здоров'я України;
• бере участь в апробації і впровадженні нових методів діагностики, лікування і профілактики ВІЛ-інфекції/СНІДу;
• проводить моніторинг поширення ВІЛ-інфекції/СНІДу серед населення країни;
• бере участь у виданні матеріалів інформаційно-просвітницького та пропагандистського характеру;
• бере участь у розробці нормативних актів з питань ВІЛ-інфекції/СНІДу;
• взаємодіє з медичними закладами інших відомств, країн, науково-дослідними інститутами, міжнародними та громадськими організаціями, діяльність яких спрямована на профілактику, догляд і підтримку ВІЛ-інфікованих та хворих на СНІД;
• здійснює експертну оцінку діяльності лабораторій діагностики ВІЛ-інфекції/СНІДу, якості надання медичної допомоги ВІЛ-інфікованим та хворим на СНІД у медичних закладах незалежно від їх підпорядкування
• отримує та аналізує оперативну і статистичну інформацію про стан захворюваності на ВІЛ-інфекцію та СНІД, визначає характер епідемічного процесу і його прогнози;
• здійснює координацію діяльності неурядових організацій з питань профілактики ВІЛ-інфекції/СНІДу;
• здійснює організацію і проведення науково-практичних конференцій, тематичних семінарів, стажувань з питань, пов'язаних з ВІЛ-інфекцією/СНІДом;
• проводить спільні дослідження з науковими установами, фірмами зарубіжних країн на основі прямих договорів (контрактів);
• проводить підготовку та перепідготовку спеціалістів Центру в зарубіжних країнах, а також зарубіжних спеціалістів на базі Центру в межах діяльності Центру;
• бере участь у заходах міжнародних організацій, наукових центрів, мета яких відповідає предмету діяльності Центру;
• бере участь у підготовці та проведенні міжнародних семінарів, конференцій тощо;
• здійснює обмін науково-технічною інформацією, використовує дані міжнародних інформаційних фондів;
• складає та подає до Міністерства охорони здоров'я України заявки щодо централізованої закупівлі за рахунок коштів Державного бюджету України лікарських засобів, тест-систем, обладнання тощо, необхідних для здійснення діагностики та лікування ВІЛ-інфікованих та хворих на СНІД.

На виконання наказу МОЗ України від 17.04.2006 р. № 230 „Про створення Референс-лабораторії діагностики ВІЛ-інфекції/СНІДу при Українському центрі профілактики і боротьби зі СНІДом" створена лабораторія для забезпечення централізованої організації, стандартизації, уніфікації діяльності діагностики лабораторій ВІЛ-інфекції/СНІДу в Україні.